对海龟影响最大的是渔捞活动，为拖网渔业。大型拖网业，在网底层加上铅条航行，除了人类爱吃的高经济价值渔种一网打尽之外，连栖息海底的虾蟹、海中洄游的海龟都无一幸免。渔业活动混获的情形，已经大量过度浪费海洋资源，许多生物死於非命，台湾的绿海龟同样也受此威胁。

绿海龟的成龟因体型硕大、背及腹甲坚硬且游泳速度迅速，因此，除了人类之外，几乎没有什么主要的天敌。虽然曾经有成龟失去一只鳍状肢或是鳍肢的末端有被噬咬的伤痕，但这种类似被鲨鱼或其他凶猛的动物如鳄鱼等攻击的状况并不多见。但小绿海龟的天敌却是非常多，在陆地有各种沙滩上的动物，如：家畜、沙蟹、浣熊、红蚂蚁、蛇、猛禽等都会对小龟进行攻击，在海中则有各种肉食性的鱼类如：鲨鱼、旗鱼等。由于缺乏足够的防御的能力、小海龟的背壳还不够坚硬、跑（游）的又不够快，因此很容易成为这些天敌的美食，小绿海龟在第一年的死亡率很高，研究资料估计，小于千分之一的小绿海龟能够长大为成龟。

在人为干扰方面，产卵栖地的破坏包括骚扰产卵母龟、不当挖掘龟卵、捕捉小海龟及不当的建设开发、挖取沙滩沙石移作他用、岸上灯光设置。骚扰产卵母绿海龟包括刻意的捕抓与无意的探访干扰，尤其以不知情游客的沙滩活动居多，因此海龟生态教育与生态旅游对保育绿海龟非常重要。过多的干扰会使母龟无法产卵，并可能永远放弃该产卵栖地；而不当挖掘龟卵、捕捉小绿海龟更是直接减少新生小龟数量，以上三因素都会使产卵栖地的绿海龟族群数量减少。

不当的建设开发、挖取沙滩沙石移作他用会使得沙滩变成砾滩，甚至消失。如此一来，母龟不但无处产卵，小海龟脱壳出后也会因爬不过砾石而晒死沙滩上。另外，岸上灯光设置，沙滩附近的路灯及或建筑物所发出的强光，会干扰凭借趋光性寻找海洋的稚龟，而找不到下海的路，过程中惨遭天敌的毒手或是曝尸道路上。

另外海洋的污染也会使得海龟感染疾病，残留的钓鱼线也可能缠绕海龟四肢或头颈造成海龟的断肢甚至死亡。以上这些人为的破坏，都严重降低海龟族群的存活率。 

2022年8月，象山韭山列岛国家级自然保护区驻岛监测员何既白在保护区中铁墩屿海域发现并拍摄到国家一级保护动物——绿海龟。